ПОЛИМОРФИЗМ

• Проекция полиморфизмов на структурно-функциональную организацию генных сетей

• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на экспрессию генов и функцию регуляторных районов генов, контролирующих транскрипцию

  • Выявление транскрипционных факторов, сайты связывания которых были изменены в результате возникновения полиморфных мутаций
  • Оценка нуклеосомного потенциала в полиморфном районе

• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на функцию регуляторных районов генов, контролирующих трансляцию:

  • Оценка стабильности вторичной структуры в 5'-НТП в норме и SNP-вариантах, прогнозирующая изменения трансляционной активности
  • Оценка изменений трансляционной активности мРНК в SNP-вариантах, связанных с контекстом стартового кодона трансляции и AUG кодонами в составе 5'-НТП мРНК

• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на первичную и пространственную структуру белков и их функцию

  • Оценка возможного влияния полиморфизмов на термодинамическую стабильность белков по первичной структуре
  • Оценка возможного влияния аминокислотных замен на термодинамическую стабильность белков по первичной структуре
  • Оценка возможного влияния полиморфизмов на термодинамическую стабильность белков по третичной структуре
• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на функциональную активность белков
• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на структуру функциональных сайтов
• Оценка возможного влияния полиморфизмов (SNP) на третичную структуру функциональных сайтов белков
• Проекция SNP на эволюционно-консервативные районы генома человека

Информационная поддержка

• База данных структурно-функциональной организации регуляторных последовательностей, контролирующих транскрипцию генов эукариот

  • TRRDSITES4   Сайты связывания транскрипционных факторов

  • TRRDUNITS4   Протяженные регуляторные районы

• База данных по экспериментально определенным значениям биологических активностей мутантных белков, создаваемая на основе реферирования научных публикаций.