ТРАНСГЕНЕЗ

Поддержка планирования генно-инженерных экспериментов на растениях и прокариотах с целью создания организмов с качественно новыми или улучшенными свойствами

• Оценка параметров экспрессии нативного варианта трансгена в организме-реципиенте

  • Поиск и анализ контекстных и структурных характеристик нативного варианта трансгена, влияющих на эффективность трансляции мРНК в системе экспрессии организма-реципиента

  • Поиск и анализ контекстных и структурных характеристик нативного варианта трансгенного белка в системе экспрессии организма-реципиента

• Компьютерный дизайн структуры модифицированного варианта трансгена с целью достижения оптимальных параметров его экспрессии в конкретном молекулярно-генетическом окружении клетки организма-реципиента

• Конструирование трансгеномов - генных сетей, контролирующих формирование целевых признаков, переносимых в растения-реципиенты с помощью векторных конструкций

• Предсказание эффективности экспрессии трансгенов на основе анализа контекстной и структурной организации 5'- и 3'-нетранслируемых районов мРНК

Информационная поддержка

• База данных TG_promoters, содержащая информацию о паттернах транскрипционной активности промоторов биотехнологически-значимых донорных генов растений (объектов трансгенеза) и их делеционных мутантов

  • TGP_GENE    Гены

  • TGP_PROMOTER    Промоторы

  • TGP_SEQUENCE    Последовательности

• База данных TRSIG, содержащая информацию о посттранскрипционных сигналах экспрессии, расположенных в составе мРНК

  • TRSIG_EXP    Экспериментальные данные

  • TRSIG_LONG    Длинные последовательности

  • TRSIG_OBJ    Пост-транскрипционные сигналы

  • TRSIG_SEQ    Последовательности регуляторных сигналов

  • TRSIG_PRODUCT    Контролируемые продукты экспрессии

• База данных PlantGeneNet, содержащая информацию о генных сетях растений, включающих биотехнологически-значимые донорные гены - объектов трансгенеза (на примере генной сети метаболизма пролина)