Программная компонента для поиска ветвей деревьев, на которых предположительно проходила адаптивная эволюция

Вернуться к программе 

ADAPTSEQ_COMP

Решаемая задача:

Поиск пар последовательностей с адаптивной фиксацией замен.

Алгоритм:

Оценка отношения  Ka/Ks и Kh/Ks скоростей замен для кодонов по алгоритму Tang and Wu (1996).

Входные данные:

Выровненные нуклеотидные последовательности в формате FASTA без делеций.

Выходные данные:

Результаты анализа участков адаптивной эволюции: таблицы отношений  Ka/Ks и  Kh/Ks для пар последовательностей.

 

 
 

 

Институт Цитологии и Генетики
Сибирское Отделение Российской Академии Наук

Адрес:630090, Новосибирск, Россия,
пр.ак.Лаврентьева,10, ИЦиГ СО РАН
Для телеграмм: Новосибирск 90, ЦИТОЛОГИЯ
Телефон: +7(383) 333·35·26
Факс: +7(383) 333·12·78
E·mail:   icg-adm@bionet.nsc.ru