Default title

RECON

Перейти к программе

Программа RECON предназначена для построения профиля нуклеосомного потенциала, характеризующего вероятность формирования нуклеосом вдоль последовательностей ДНК. Программа используется для распознавания сайтов формирования нуклеосом (СФН) в последовательностях геномной ДНК.

Входные данные и опции программы

Последовательность ДНК длины более 160 нт и менее 100.000 нт. Последовательности ДНК в алфавите "ATGCatgc", допускаются также символы "Nn", но вблизи их сосредоточения сайты не могут быть предсказаны, то есть данные символы игнорируются программой. Включение нормировки выходного профиля по стандартному отклонению приводит профиль к интервалу значений до единицы.

Выходные данные программы

Выходные данные программы организованы в виде текстового файла. Файл содержит профиль, который для каждой позиции в последовательности отмечает соответствующее значение функции распознавания. Позиции профиля, для которых программа не рассчитывает значение профиля на основе экстремальности нуклеотидного или динуклеотидного состава отмечаются символом '*'.

Запуск программы

Для запуска программы необходимо: Ввести последовательность ДНК в простом формате в специальное окошко или указать файл с последовательностями ДНК;
Указать включение или выключение нормировки выходного профиля по стандартному отклонению (опция 'Нормировка по стандартному отклонению');
Нажать кнопку 'ВЫПОЛНИТЬ'.

 

 
 

 

Институт Цитологии и Генетики
Сибирское Отделение Российской Академии Наук

Адрес:630090, Новосибирск, Россия,
пр.ак.Лаврентьева,10, ИЦиГ СО РАН
Для телеграмм: Новосибирск 90, ЦИТОЛОГИЯ
Телефон: +7(383) 333·35·26
Факс: +7(383) 333·12·78
E·mail:   icg-adm@bionet.nsc.ru