Программная компонента для оценки консервативности позиций выравнивания последовательностей белков

Вернуться к программе

CONS_COMP

Решаемая задача:

Оценка консервативности позиций множественного выравнивания аминокислотных последовательностей и сравнение с профилем структуры или функции позиций белка.

Алгоритм:

Алгоритм оценивает количество информации для каждой колонки множественного выравнивания по частотам встречаемости аминокислот.

Входные данные:

Выровненные аминокислотные последовательности в формате FASTA.

Выходные данные:

Профили консервативности множественного выравнивания, профиль функции/структуры, введенный пользователем.

 

 
 

 

Институт Цитологии и Генетики
Сибирское Отделение Российской Академии Наук

Адрес:630090, Новосибирск, Россия,
пр.ак.Лаврентьева,10, ИЦиГ СО РАН
Для телеграмм: Новосибирск 90, ЦИТОЛОГИЯ
Телефон: +7(383) 333·35·26
Факс: +7(383) 333·12·78
E·mail:   icg-adm@bionet.nsc.ru