RECON
Перейти к программе
Программа RECON предназначена для построения профиля нуклеосомного потенциала,
характеризующего вероятность формирования нуклеосом вдоль последовательностей ДНК.
Программа используется для распознавания сайтов формирования нуклеосом (СФН)
в последовательностях геномной ДНК.
Входные данные и опции программы
Последовательность ДНК длины более 160 нт и менее 100.000 нт.
Последовательности ДНК в алфавите "ATGCatgc", допускаются также символы "Nn",
но вблизи их сосредоточения сайты не могут быть предсказаны, то есть данные
символы игнорируются программой. Включение нормировки выходного профиля по стандартному
отклонению приводит профиль к интервалу значений до единицы.
Выходные данные программы
Выходные данные программы организованы в виде текстового файла.
Файл содержит профиль, который для каждой позиции в последовательности отмечает
соответствующее значение функции распознавания. Позиции профиля,
для которых программа не рассчитывает значение профиля на основе экстремальности
нуклеотидного или динуклеотидного состава отмечаются символом '*'.
Запуск программы
Для запуска программы необходимо:
Ввести последовательность ДНК в простом формате в специальное
окошко или указать файл с последовательностями ДНК;
Указать включение или выключение нормировки выходного профиля по стандартному отклонению
(опция 'Нормировка по стандартному отклонению');
Нажать кнопку 'ВЫПОЛНИТЬ'.