Программная компонента для поиска позиций, определяющих специфичность функции белков

Вернуться к программе

SPECPOS

Решаемая задача:

Поиск позиций множественного выравнивания аминокислотных последовательностей, мутации в которых обуславливают специфичность функции белка.

Алгоритм:

Алгоритм поиска основан на применении теории информации и описан в работе (Kalinina et al,  Protein Science (2004), v. 13, p.443–456).

Входные данные:

Выравненниые аминокислотные последовательности в формате FASTA, группировка последовательностей на функциональные классы.

Выходные данные:

Результат определения функциональных позиций белка.

 

 
 

 

Институт Цитологии и Генетики
Сибирское Отделение Российской Академии Наук

Адрес:630090, Новосибирск, Россия,
пр.ак.Лаврентьева,10, ИЦиГ СО РАН
Для телеграмм: Новосибирск 90, ЦИТОЛОГИЯ
Телефон: +7(383) 333·35·26
Факс: +7(383) 333·12·78
E·mail:   icg-adm@bionet.nsc.ru