Вернуться к программе
ADAPTSITE_COMP
Решаемая задача:
Поиск участков адаптивной эволюции в последовательностях, кодирующих белки.
Алгоритм:
Оценка отношения Ka/Ks
скоростей замен для кодонов в
последовательности.
Входные данные:
Выравненные нуклеотидные последовательности, которые кодируют белки, без делеций, в формате FASTA, филогенетическое дерево для этого набора последовательностей.
Выходные данные:
Оценка скоростей замен в позициях белка, оценка числа позиций, в которых замены проходили адаптивным образом
.