Комплексное распознавание сайтов связывания транскрипционных факторов

Vitt

Вставьте в окно анализируемую последовательность ДНК (в FASTA формате)

или загрузите из файла:

Выберите транскрипционные факторы
Эукариотические:
AP1
ARNT
CEBP A
CEBP
CLOCK
cMyc
CRE
CREB
E2F
EGR1
EKLF
ER2
GATA1
GATA
GATA2
GATA3
HMG1
HNF1
HNF3
HNF4
IRF1
ISGF3
MyoD
Nf_E2
NF1
NFATp
NFkB_hetero
NFkB_homo
NFkB
NFY
NRF2
OCT
OCT1
p53
PPAR
Pu1
SF1
SREBP
SRF
STAT
STAT1
TTF1
USF
YY1
ABL1 ArtSite(AS00241)
AG ArtSite(AS00298)
AHR_ARNT ArtSite(AS00005)
AHR2 ARNT ArtSite(AS00006)
ALF2sel ArtSite(AS00308)
ALFIN1 ArtSite(AS00332)
ANT ArtSite(AS00370)
AP2 ArtSite(AS00103)
AP2A ArtSite(AS00186)
AR ArtSite(AS00323)
AREB6 ArtSite(AS00030)
ARNT_ARNT ArtSite(AS00003)
ATHB1 ArtSite(AS00159)
BCL6 ArtSite(AS00242)
BRACHYURY ArtSite(AS00155)
BRN2 ArtSite(AS00409)
BRN3A ArtSite(AS00209)
BRN3A_POU ArtSite(AS00208)
BRN3B ArtSite(AS00210)
BRN5 ArtSite(AS00401)
CACD ArtSite(AS00017)
CDP ArtSite(AS00218)
cFOS ArtSite(AS00008)
CIZ ArtSite(AS00093)
CLOX_CUT ArtSite(AS00223)
CLOX_HD ArtSite(AS00220)
CM_CDP_CLOX ArtSite(AS00217)
CM_MCM1_SRF ArtSite(AS00290)
CMYB ArtSite(AS00234)
CMYC_MAX2 ArtSite(AS00129)
CREB ArtSite(AS00246)
CSX ArtSite(AS00408)
CUTL1_CR1 ArtSite(AS00248)
CUTL1_CR3HD ArtSite(AS00250)
CZF1 ArtSite(AS00109)
DEF1 ArtSite(AS00002)
E2F1DP1 ArtSite(AS00123)
E2F1DP2 ArtSite(AS00124)
E2F4DP1 ArtSite(AS00125)
E2F4DP2 ArtSite(AS00126)
E47 ArtSite(AS00212)
E74A ArtSite(AS00170)
ELF1 ArtSite(AS00363)
ELK1 ArtSite(AS00270)
ELK1_SRF ArtSite(AS00320)
EN ArtSite(AS00350)
EN1 ArtSite(AS00112)
ERRA ArtSite(AS00268)
ETS1 ArtSite(AS00161)
ETS1_CBF ArtSite(AS00257)
EVI1_ZF5-7 ArtSite(AS00188)
EVI1_ZP1-7 ArtSite(AS00187)
EVI1_ZP1-7 ArtSite(AS00197)
EVI1_ZP4-6 ArtSite(AS00189)
EVI1_ZP4-6 ArtSite(AS00198)
FAC1 ArtSite(AS00065)
FLI1 ArtSite(AS00202)
FOXM1 ArtSite(AS00411)
GAMYB ArtSite(AS00349)
GATA1 ArtSite(AS00058)
GATA2 ArtSite(AS00036)
GATA3 ArtSite(AS00347)
GATA6 ArtSite(AS00331)
GBF1 ArtSite(AS00304)
GCN4 ArtSite(AS00315)
GFI1 ArtSite(AS00201)
HEN1 ArtSite(AS00199)
HFH8 ArtSite(AS00105)
HLF ArtSite(AS00251)
HMG1 ArtSite(AS00307)
HMG1Y ArtSite(AS00303)
HMX3 ArtSite(AS00091)
HNF1A ArtSite(AS00106)
HOX11 ArtSite(AS00229)
HOX11 CTF1 ArtSite(AS00344)
HOX11_HD ArtSite(AS00227)
HOX11_HDM ArtSite(AS00228)
HOX7 ArtSite(AS00110)
HOXA11 ArtSite(AS00099)
HOXA3 ArtSite(AS00111)
HOXB9 ArtSite(AS00098)
HOXD1 ArtSite(AS00316)
HSF1 ArtSite(AS00179)
HSF2 ArtSite(AS00180)
IBR ArtSite(AS00336)
IKAROS1 ArtSite(AS00152)
IRF1 ArtSite(AS00062)
IRF2 ArtSite(AS00063)
IRF3 ArtSite(AS00368)
IRF7 ArtSite(AS00369)
KN1 ArtSite(AS00382)
KRC ArtSite(AS00402)
LHX3 ArtSite(AS00333)
LHX3_HD ArtSite(AS00334)
MAD MAX ArtSite(AS00225)
MAX ArtSite(AS00053)
MAX2 ArtSite(AS00131)
MCLOX ArtSite(AS00219)
MCM1 ArtSite(AS00288)
MEF2 ArtSite(AS00256)
MEIS1A HOXA-9 ArtSite(AS00095)
MEIS1B ArtSite(AS00094)
MEIS1b_HOXA9 ArtSite(AS00096)
MEL18 ArtSite(AS00064)
MIDA1 ArtSite(AS00338)
MIZF ArtSite(AS00420)
MOK2 ArtSite(AS00195)
MOP3_MOP4 ArtSite(AS00077)
MYBAS1 ArtSite(AS00407)
MYBPH3 ArtSite(AS00177)
MYC_MAX ArtSite(AS00052)
MYOD ArtSite(AS00116)
MYOG ArtSite(AS00115)
MZF1_ZFC ArtSite(AS00231)
MZF1_ZFN ArtSite(AS00230)
NFE2 ArtSite(AS00034)
NFE2L1 ArtSite(AS00377)
NFE2L1_MAFG ArtSite(AS00387)
NKX3A ArtSite(AS00372)
NKX6A ArtSite(AS00144)
NMYC ArtSite(AS00253)
OCT1 ArtSite(AS00018)
OCT2 ArtSite(AS00107)
OCT2B ArtSite(AS00073)
OVO ArtSite(AS00367)
P53 ArtSite(AS00089)
P53 ArtSite(AS00232)
PAX2 ArtSite(AS00010)
PAX6 ArtSite(AS00009)
PBX1_HD ArtSite(AS00293)
PBX1B ArtSite(AS00081)
PBX1HD ArtSite(AS00083)
PBX2 ArtSite(AS00084)
PBX3 ArtSite(AS00085)
PD2 ArtSite(AS00301)
PP ArtSite(AS00294)
PPARG RXRA ArtSite(AS00023)
PRD ArtSite(AS00013)
PRIB ArtSite(AS00340)
RB ArtSite(AS00235)
RB E2F1 DP1 ArtSite(AS00127)
REB1 ArtSite(AS00365)
REP68 ArtSite(AS00357)
REP78 ArtSite(AS00358)
RORA1 ArtSite(AS00032)
RORA2 ArtSite(AS00033)
RP58 ArtSite(AS00383)
RTR ArtSite(AS00244)
RUSH1 ArtSite(AS00306)
RXRG ArtSite(AS00299)
S8_HD ArtSite(AS00143)
SAP1 ArtSite(AS00285)
SIM_ARNT ArtSite(AS00004)
SON ArtSite(AS00399)
SOX5 ArtSite(AS00021)
SOX9 ArtSite(AS00027)
SPI1 ArtSite(AS00329)
SPIB ArtSite(AS00330)
SPZ1 ArtSite(AS00322)
SREBP1 ArtSite(AS00164)
SRF ArtSite(AS00007)
SRY ArtSite(AS00066)
STE11 ArtSite(AS00065)
TAX CREB ArtSite(AS00247)
TEF1 ArtSite(AS00314)
TH1_E47 ArtSite(AS00169)
UNC86 ArtSite(AS00211)
USF ArtSite(AS00239)
USP ECR ArtSite(AS00328)
VJUN ArtSite(AS00213)
VMAF ArtSite(AS00215)
VMYB ArtSite(AS00295)
VMYB_MUT ArtSite(AS00271)
VND_HD ArtSite(AS00224)
WT1 ArtSite(AS00262)
XBP1 ArtSite(AS00206)
YY1 ArtSite(AS00001)
ZF5 ArtSite(AS00086)
ATF
cFos
cJun
cMyb
COUP
CP1
CRBP
E2
EN
ER
Ets
GAGA
Gal4
GR
HSF
MEF2
NFIL6
PR
RAR
RFX
RXR
Sp1
T3R
TCF1
Прокариотические:
arca
crp
fis
fnr
frur
ihf
lrp
narl

generated in 1.4260759353638 seconds

 

 
 

 

Институт Цитологии и Генетики
Сибирское Отделение Российской Академии Наук

Адрес:630090, Новосибирск, Россия,
пр.ак.Лаврентьева,10, ИЦиГ СО РАН
Для телеграмм: Новосибирск 90, ЦИТОЛОГИЯ
Телефон: +7(383) 333·35·26
Факс: +7(383) 333·12·78
E·mail:   icg-adm@bionet.nsc.ru